Dalam serial Kartun Spongebob Squarepant memang terdapat bebrapa misteri yang belum diketahui kepastiannya.namun ada beberapa misteri yang sudah terpecahkan.

1.PEARL ANAK SIAPA?.
pearl,siapa yang tidak tahu dengan anak Mr.krab ini.dia merupakan seekor paus sedangkan krab adalah Kepiting.ternyata baru-baru ini sudah diketahui bahwa pearl 100% adalah anak pungut.mana mungkin krab memiliki anak ikan paus.

2.ROCK BOTTOM TIDAK ADA DI PETA BIKINI BOTTOM
bikini bottom,kota besar dimana spongebob dkk-nya bertempat tinggal.di peta dijelaskan bahwa hanya ada Bikini bottom,jellyfish field, dan goo lagoon yang hanya ada bikini attol.rock bottom dulunya adalah bagian dari bikini bottom namun sebagian kota itu runtuh sehingga dianggap kota yang hilang dan dinyatakan sebagai rock bottom sejak ditemukan.jika diartikan bisa berarti "Bottom(bikini bottom) bergoncang" atau "bikini bottom yang karam".penduduk rock bottom sama sekali tidak pernah tampak ke bikini bottom.

3.siapakah What zit tooya?
ketika tuan krab akan memeberi hadiah kepada orang yang bisa mengetahui nama pelanggan yang ke-100,squidward mencuri KTP dan menemukan nama pelanggan yang ke-100 adalah "WHAT ZIT TOOYA".sebenarnya itu bukan nama aslinya.jadi,siapakah namanya yang sebearnya?.ternyata,what zit tooya adalah detektif kepolisian bikini bottom.